Luis Filipe Das Neves Kalchhauser Cunha

Licenciado em Biologia pela Universidade dos Açores (2005), com Mestrado em Biologia, Cultura e Pescas de Invertebrados pela Universidade de Bangor (2006) e Doutoramento em Biologia Celular e Molecular pela Universidade dos Açores (2012, com distinção). É Investigador Coordenador no Centro de Ecologia Funcional (Universidade de Coimbra), onde dirige o Laboratório de Genómica Ambiental (EnGeL-UC) no UC-Biotech em Cantanhede, e é Fellow da Higher Education Academy (FHEA) do Reino Unido. A sua investigação centra-se na biodiversidade do solo, na genómica funcional e na bioinformática, com especial interesse na forma como a perturbação antrópica e as práticas de gestão moldam as comunidades edáficas e as funções dos ecossistemas. Tem estado ativamente envolvido em projetos genómicos e transcriptómicos baseados em sequenciação de nova geração (NGS), abrangendo ecologia evolutiva, filogenética molecular, genética de populações e metagenómica de organismos metazoários e comunidades microbianas do solo. Destaca-se o seu trabalho pioneiro no âmbito do projeto “HookaWorm” (Marie Curie Global Fellowship, 2015–2018), que utilizou a genómica de anelídeos como proxy para rastrear o movimento e assentamento humano antigo na Amazónia. Durante o seu doutoramento, o ambiente geotérmico vulcânico dos Açores funcionou como “laboratório natural” para explorar a ecogenómica do stress em condições extremas, revelando adaptações notáveis em espécies colonizadoras de habitats efémeros. Desde a conclusão do doutoramento, publicou a uma média superior a 2,5 artigos por ano em revistas de referência nas áreas de ecotoxicologia, biologia do solo, ecologia evolutiva e bioinformática, com fatores de impacto tipicamente entre 4 e 16 (p. ex., Nature Communications, Global Change Biology, Soil Biology and Biochemistry, Heredity, Life Science Alliance, Science of the Total Environment). Apresenta atualmente um índice H de 18 (Scopus). É co-autor de um capítulo seminal sobre a biologia da fauna do solo no volume Managing Soil Health for Sustainable Agriculture e co-autor do primeiro capítulo do volume Measuring and Assessing the Biological Health of Soils (2025). Coordena o WP4 do projeto europeu BENCHMARKS (Horizon Europe, €12M), centrado na avaliação e harmonização de abordagens de monitorização da saúde do solo em 28 sítios de estudo europeus, e participa em múltiplos projetos Horizon Europe adicionais (SYBERAC, VALERECO, GRASS4FUN, GOOD, BETTER-B, PARC, EESE, entre outros), tendo garantido mais de €3M em financiamento de investigação ao longo da sua carreira (na qualidade de PI e co-I). Tem supervisionado 1 bolseiro de pós-doutoramento, 2 estudantes de doutoramento em curso, e orientado mais de 9 estudantes de mestrado e vários projetos de fim de licenciatura. Organizou e liderou 6 expedições científicas de campo em ecossistemas tropicais (Amazónia, Brasil; Guiana) e insulares (Açores), coordenando equipas de até 20 investigadores e estudantes. É conferencista convidado habitual em reuniões internacionais e em eventos de divulgação científica, com intervenções que vão da transcriptómica em ecotoxicologia à interculturalidade na investigação em ciências biológicas. A sua capacidade de iniciativa pessoal ficou também demonstrada num projeto de crowdfunding científico para sequenciação do genoma de uma minhoca vulcânica, que gerou cobertura mediática internacional, incluindo a Newsweek. É revisor ativo em várias revistas internacionais e membro de sociedades como a SETAC, a British Ecological Society, a Systematic Biology Society, a Society for the Study of Evolution, a International Society of Computational Biology e a European Reference Genome Atlas (ERGA).